万历二十八年，努尔哈赤打算将孟格布禄送回国。没想到小妾法赖与孟格布禄私通被人撞破，结果牵连出一桩谋逆篡国大案。孟格布禄、噶盖、法赖，三人被处死。
万历二十九年正月，明朝遣使要求努尔哈赤帮助哈达复国，努尔哈赤便将女儿莽古济嫁给孟格布禄之子武尔古岱。随后，武尔古岱带领所部人民归国。
没多久，叶赫部同蒙古兵一道频频侵犯哈达，努尔哈赤上书明朝谴责叶赫，明神宗对事此置之不理。
恰好，哈达爆发了严重的饥荒，饥民逃难到开原要粮，明朝坐视不管，不予放粮。饥民只好忍饥挨饿。努尔哈赤抓住机会，开仓赈灾，百般安抚，尽收人心，使得哈达国人纷纷投入建州，名正言顺的吞并了哈达。
哈达的灭亡，极大的增强了建州女真的实力，为努尔哈赤消灭剩下的海西三部打开了进兵通道。
这年，努尔哈赤创建黄、白、红、蓝，四旗。
女真人世代以渔猎而生。清实录记载：“复编三百人为一牛录。每牛录设额真一。先是我国凡出兵校猎。不计人之多寡。各随族党屯寨而行。猎时、每人各取一矢。凡十人、设长一。领之。各分队伍。“旗就是从这种原始生产组织慢慢演化而来。
努尔哈赤把人口编为若干个固定单位。生产生活，行军战斗，平时为民，战时为兵，统一指挥，发号施令。这种高效的管理模式，使得建州女真的军事实力和生产能力明显提高。
女真统一，指日可待。
