在诸葛亮上台之初，不仅面临着缺乏帮手的局面，同时蜀汉内外也是忧患重重，外部曹魏势大，遣使劝降，孙权虽谈，但依然不稳，内部南方叛乱，雍闿、孟获作乱。
面对这个局面，诸葛亮内修政治，外部连孙抗曹，南下平定叛乱。
在刘备死后，诸葛亮成为了蜀汉实际上的统治者。他不仅领益州牧，政事上的大小事务，刘禅也都依赖于诸葛亮，由诸葛亮决定。
据《魏略》记载，初备以诸葛亮为太子太傅，及禅立，以亮为丞相，委以诸事，谓亮曰：“政由葛氏，祭则寡人。”亮亦以禅未闲於政，遂总内外。
据《诸葛亮集》记载，同年，司徒~华歆、司空王朗、尚书令陈群、太史令许芝以及谒者仆射诸葛璋分别致书与蜀相诸葛亮，向其陈说天命人事，希望蜀汉能举国称藩，但徒劳无功。
诸葛亮没有回书，而是写了一篇正议：“昔日西楚霸王项羽，不以仁德对待百姓，即使力量强大，有帝王的威势，最终还是身败名裂，成为千古遗恨。如今魏国不吸取项羽灭亡的教训，反而去追求效仿，即使曹操有幸不死，他的后代子孙也必然要灭亡的。那些写书劝降我的人，他们一把年纪了行事却顺从贼子之意，就像当年陈崇、孙竦称赞王莽篡汉一样，讨好盗贼，却还是被盗贼逼迫而死！光武帝创业时，率领几千人就在昆阳郊外一举击溃敌军四十万。足见以正道伐淫邪，胜败不在人数。曹操诡诈，纠集十万人来战先帝，妄图救张郃于阳平，却只落得狼狈逃窜，不但辱没了精锐之师，还丢掉了汉中，此时他才知道，国家是不能随便窃取的，没及他退军回到家，就已染病身亡。曹丕骄奢淫逸，篡夺帝位。即便你们几个像张仪、苏秦那么能诡辩，说得天花乱坠、滔滔不绝，也不可能诋毁尧、舜，白白浪费笔墨而已！正人君子绝不会这么做。《军诫》中说：‘如果一万名士卒，抱着必死的决心，那就可以天下无敌了’昔日轩辕皇帝率领几万士卒，还能击败四位帝王，平定天下。何况我们有几十万兵马，是在替天行道，讨伐有罪的人，那谁还能够与我们匹敌呢！”
在刘备死后，蜀汉面临的局面很是艰难，核心人物已经大多逝去，曹魏甚至直接欺负蜀汉无人，要求其刘禅、诸葛亮投降。而蜀汉的国力经过襄樊之战、三郡之变以及夷陵之战已经大损，南郡等三郡被江东夺取，上庸等地被曹魏占据，和孙权、曹丕之间的关系也谈不上好，南方的叛乱更是还有着盟友孙权的影子。
无人、无兵、国力不足、内部有乱、缺乏盟友，这就是诸葛亮上台之初面临的局面。
面对曹魏的欺压，诸葛亮只能以以大义驳斥，然而幸运的是当时的魏帝曹丕一门心思收拾孙权，对于蜀汉没有进一步的动作，给了诸葛亮缓冲的时间。这点和《三国演义》中记载完全不一样的，在正史中并没有五路大军伐蜀的事情，当时曹丕和孙权已经闹翻了，孙权不可能还未曹丕效力的，而孟获并不是南中叛乱的主谋，雍闿才是。罗贯中后来写诸葛亮骂死王朗一事也应该此时王朗等人劝降有关系，正史上王朗和诸葛亮之间联系并不多。
对于盟友孙权的重要性，在经过诸多事情之后，诸葛亮有着更为深刻的认识，他很清楚荆州已经要不回来，而要对付曹魏，孙权是不可缺少的，所以诸葛亮对于孙权放的态度很低，也很真诚，而孙权也不傻，双方和则两利。
面对南方的叛乱，诸葛亮并没有第一时间给以回应，首先是蜀汉经过一系列的打击之后，国力大损，而刘备也刚刚去世，事物繁多，诸葛亮无法集中精力，集中力量平定叛乱；其次蜀汉当时连续作战，兵力受损较大，不宜再战；再次南方雍闿等人后面有着孙权的影子，所以诸葛亮要先搞定东吴，断绝雍闿可能的外援；南中整体叛乱，事情很大，而蜀汉也输不起了，所以诸葛亮要先等等，把握大了之后再动手。
经过两年的修养生息后，蜀汉粮草补给已经充足，孙权也已经被搞定，诸葛亮果断出兵了，一战功成，平定了南中四郡的叛乱。
历史上南中四郡一直是蜀汉集团控制的一个薄弱地带，在刘备早期入益州时，就没有发兵过南中四郡，这一带早期就只是在表面上表示了对刘备的臣服，所以蜀汉对这里的控制一直不牢靠，而且这一带少数民族很多，汉族的优势不大，所以很容易出现动~乱。
在诸葛亮初步平定叛乱后，南中一带的叛乱依然不少，最后蜀汉不得不留马忠、张嶷等人平乱。历史上yn县在汉朝已经被设立，诸葛亮平定南中后，进一步建立了yn郡，后来yn逐渐被建为省。
诸葛亮在平定南中后，看到当地的少数民族凶悍，就以他们为基础，建立了无当飞军。诸葛亮为了避免恢复和平后，那些剽悍的战士便陷于失业，于是将他们整合起来，就此实施了一箭双雕的有利政策，就是征召少数民族战士加入蜀国政府军，而经费问题，就由当地地方豪强解决。
无当飞军在历史上夷汉部曲都是主力。他们皆身披铁甲，能翻山越岭，善于使用弓弩和毒箭，尤其精于防守作战，在后来诸葛亮北伐时有着很出色的表现，蜀国后来委任治军严谨的魏国降将，王平为该军团第一任统帅。
就此，诸葛亮在刘备死后两三年内就已经大体上恢复了蜀汉的和平，并且重新与孙权达成了同盟，之后诸葛亮暂时蛰伏于南方，积蓄力量，等待着时机的来临。
