女娲氏部落女名叫女登，为有娇氏之女。这一天，女登在华阳游玩，正直日午时分，烈日炎炎，人懒困乏，女登在烈山寻一山洞石室小憩，凉风习习，迷迷糊糊间只觉一道人驾云前来，眉清目秀，仙风道骨，手持一柄红光艳艳的拂尘，一身道袍装扮，紫兰绣于其上，华美异常。
那道人对女登微微一笑，言道：“还不结圣主麟儿！”在女登疑惑间，一神龙从这道人脑后光轮中飞出，通体碧绿如翡翠，身姿矫健，张牙舞爪，遨游天际，腾云驾雾，一阵撼天动地的龙吟声后，飞到女登面前，盘绕其身一口赤红龙炎喷出，直扑女登肚腹而来。
正在小憩的女登尖叫一声，醒来，冷汗涔涔，环顾左右，却不见那道人和神龙的身影，用秀手稍微抚胸，粗喘几口气，抹一抹额头的汗水，一望日天，还是正午时分，太阳似乎就没有移动丝毫。
女登以为只是噩梦，觉得这山洞乃不祥之地，于是就要起身下山。却不料一起身，一阵阵痛，疼得女登大呼，片刻间就见肚皮如同气球般快速涨大，在女登惊骇欲绝的眼神之下，一人身牛首、通体晶莹剔透，可见五脏的孩子从肚中而出。 女登一开始以为是怪物，惊慌失措，但是毕竟血脉相连，看着饥饿的孩童，不忍心，掀起衣服，开始喂奶。
只是这孩子不知怎么生下，又如此奇异，该如何是好？心中忧虑，眼看再不下山，就要黑夜降临，女登只得抱着孩子慢慢腾腾往部落赶去。 在族人的一番询问下，女登红着脸，说了经过，族人大奇。有人就说，自古大贤降世，必有异象。伏羲圣皇就是其生母华胥感雷泽雷神脚印而生，蛇首人身。此子将来必有一番作为。
三日一过，女登正在草屋之中，为自家孩子而忧愁，不知如何是好。突然天际飘来一朵祥云，降落在九尺高空，一阵异香袭地，地涌金莲，天花乱坠，烟岚重重，彩虹横贯，一青袍绣紫兰的年轻道人，手持拂尘，宣一声道号，喊道：“贫道瀛台岛恒宇，特来拜会女登姑娘。” 声音传遍部落村庄，无数族人探头探脑，看到如同神人模样的恒宇，纷纷拜倒，磕头如捣蒜。 正在喂养婴孩的女登抱着孩子出来，就看到梦中出现的那道人，屈身下拜，言道：“可问道长是否就是我那梦中道人？”结结巴巴，神情似乎既紧张又兴奋。 曹开点头，言道：“不错，贫道正是。此来是为你手中麟儿而来，他乃天命之人，将为人族共主，建不世之功。我希望辅佐与他，你可愿意？” 早被惊得目瞪口呆的女登连连点头，“愿意，愿意，还望道长不嫌弃我儿。”
于是，曹开就住在了姜水旁边的村庄，开始照顾这孩子。
不愧为天命之子，这孩子三天能说话，五天能走路，三岁知稼穑，长成后，身高八尺七寸, 龙颜大唇，姓“伊耆”，名“石年”。以姜为姓，从母为烈山氏，从父号神农氏。
石年殚精竭虑，白天处理族中事务，晚上求教于慈航，曹开也不教其太多诸如甘霖术、回春术之类，只教大道至理，不教法术傍身，所以日复一日，石年道行越来越高，却是丝毫法力没有。
正因为道行高深，却能够越发体会到人族疾苦，誓要造福一方。
人族此时不懂农业，靠打猎、捕鱼、采摘野果为生，食不果腹，经常忍饥挨饿，衣不蔽体。
看到族人这种苦境，石年心里极为不安，日思夜想，要大家过上丰衣足食的安安稳稳的日子。他想，要是有一种草结出的果子又多又能吃，那就好了。
他告别曹开和母亲女登，不辞辛苦，冒着生命危险，走遍了名山大河，尝尽了无数千奇的果子，有一次误吃了毒果差点送了命。
石年丝毫不灰心，一日在南方一个山清水秀的地方拨开灌木寻找那种能借无数果实的神草。不想，一只五彩丹雀（属凤凰）口衔一绽放霞光的九穗禾，盘旋其头顶三圈，扔下飞走。石年好奇之下，拿起，一看之下大为惊喜，穗颗粒极多，刚好满足此行目的。
这九穗禾却也奇特，生有五种不同的谷类，为麻、黍、稷、麦、菽，色呈五彩。 石年高高兴兴的回到姜水，却发现大家还不大会种地，只是刀耕火种，产量很低。石年冥思苦想，最后制成木质耒耜，用来翻地；又看到某些土块坚硬，人力不足，又开始驯化牛，用来耕地。有时干旱无雨，庄稼难免颗粒无收，于是石年又带领族人凿井灌溉。
第一次长出来的五谷，有神奇之效，吃下之后，长生不老。
这些努力使得姜水部落迅速壮大，本属于朱襄氏分支，被族人察觉，推举为朱襄氏酋长。因为他斲木为耜，揉水为耒，耜耒之利以教天下，以其神于农业，故曰“神农”。 当时除了伏羲传下的制作葫芦瓢当做水器外，人族还未产生其他舀水器物，石年捏制陶土，制成陶器，其中以夹砂黑陶和夹砂灰陶为主。 泥质黑陶、灰陶、夹砂粗红陶次之，泥质红陶较少，泥质白陶最少。除少量的素面陶外，纹饰有篮纹、附加堆纹、凹凸弦纹、方格纹、镂孔刻划纹、绳纹、叶脉纹和少量的彩陶等。 器形有鼎、罐、厚胎喇叭形红陶环、陶纺轮、碗、盆、圈足盘、器盖、瓮、尖底缸、长颈壶、四足方鼎等。这给人族的生活带来巨大的改变。
在陶器发明前，人们加工处理食物，只能用火烧烤，有了陶器，人们对食物可以进行蒸煮加工，还可以贮存物品，酿酒，消毒。陶器的使用，改善了人类的生活条件，对人族的饮食卫生和医药发展产生了深远的影响。
同时为了保护粮食收成和族人安危，石年削木为弓，制造了弓箭。
神农管理部落，不望其报，不贪天下之财，而天下共富之。智贵于人，天下共尊之。他以德以义，不赏而民勤，不罚而邪正，不忿争而财足，无制令而民从，威厉而不杀，法省而不烦，人民无不敬戴。 日益壮大的部落，和长期积累的人望，使得石年被氏族联盟在伏羲氏传承十五代之后取而代之，开始了轰轰烈烈的神农氏时代。
因为神农石年出生之时生具火德，善于焚山开垦，开火制陶，于是族人相信神农乃是秉承火德的圣贤，于是称为“炎帝”，至此“炎帝”称为一个帝号。 因为种种原因，太昊伏羲所建都城宛丘，三度迁移，三度重建。神农继位，秉承伏羲遗志，在太昊废墟之上建立国都陈。 可是身居高位，神农却越发谨慎，发觉大部分人族食用野兽血肉，长此以往，慢慢肌体出现了病症，即使小病，也因为无人懂得医术，而深受病痛折磨，痛苦不堪。 神农有感于此，有开始要到深山老林，去寻找草药，医治百姓。
石年离开部落，开始了尝百草的旅程。 一天，神农氏在深山老林采药，被一群毒蛇围住。毒蛇一起向神农氏扑去，有的缠腰，有的缠腿，有的缠脖子，想致神农氏于死地。神农氏寡不敌众，终被咬伤倒地，血流不止，浑身发肿。他忍痛高喊：“道兄，快来救我。”
五庄观镇元子正与曹开一起在瑶池做客，突然心神震动，掐指一算，忙请西王母出手，派青鸾衔着一颗救命解毒仙丹在天空中盘旋窥瞰，终于在一片森林里找到了神农氏。毒蛇见到了青鸾，都吓得纷纷逃散。 青鸾将仙丹喂到神农氏口里，神农氏逐渐从昏迷中清醒。 青鸟乱成使命后翩然腾云驾雾回归。神农氏感激涕零，高声向青鸟道谢。 哪知，一张口，仙丹落地，立刻生根发芽长出一棵青草，草顶上长出一颗红珠。神农氏仔细一看，与仙丹完全一样，放入口中一尝，身上的余痛全消，便高兴地自言自语：“有治毒蛇咬伤的药方了！” 于是，给这味草药取名“头顶一颗珠”。后来，药物学家给它命名为“延龄草”。
石年并没有被眼前的困难所吓倒，依旧不改初衷，一路从北往南而行，在巴蜀之地，不小心尝到毒草断肠草，遍体发紫，浑身僵硬，眼看就要毒发身亡。
不想，这时天际一道青虹飞来，一道光华裹挟一颗金光灿灿的仙丹被射入石年嘴中，一阵青色光辉开始从嘴部绽放，如同流水席卷全身，避退紫色毒物，片刻之后，只见无数紫色烟雾从石年体内喷薄而出，曹开绣袍一甩，无数紫雾聚拢凝结，化为一枚紫色丹药，被慈航收起。
神农石年见得曹开，两行浊泪滚下，哽咽道：“贫道无能，拖累道兄了。” 曹开感慨一声，扶起神农，对他说道：“你现在乃是凡人之躯，即便生伟玲珑玉体，可以看到五脏六腑，辨别草药属性，但是有些毒物毒性极强，怕是等不到你察觉，就可能要了你的命。”
说着，拿出随身的红丝拂尘，一摆，化作一赭鞭（赭，红土的意思），通体赤色。对抬头看着自己的石年言道：“这是我自地皇娘娘手中求来的拂尘所化，在试药之前，用其碰触草药，可以详尽得了解草木是有毒还是无毒，是凉性还是温性。” 石年拜谢一番，接过，爱不释手，破涕而笑，曹开对他言道：“当不畏艰险，完成此不世之功，切记，切记！”言罢，驾云而去。
石年朝曹开离去方向一拜，拿起赭鞭，又开始了尝百草的进程，曾经一日之内中了七十次毒，被赭鞭所救。 神农尝百草时，随身带着一只能看到五脏六腑、十二经络、帮助他识别药性的活“仪器”———獐鼠，又名“獐狮”。民间有“药不过獐鼠不灵”之说。
一天，行到神农架，这只獐鼠吃了巴豆，腹泻不止。神农把它放在一棵青叶树下休息，过了一夜，獐鼠奇迹般地康复了，原来是獐鼠吸吮了青树上滴落的露水解了毒。 神农氏摘下青树的青叶放进嘴里品尝，顿感神志清爽、甘润止渴。 神农氏教人们种了这种青树，它就是现在的茶树。这就有神农架民间传唱着“茶树本是神农栽，朵朵白花叶间开。栽时不畏云和雾，长时不怕风雨来。嫩叶做茶解百毒，每家每户都喜爱”的山歌。
但是天有不测风云，人有旦夕祸福，终于在秦岭登天台山，不小心吞食“火焰子”的毒草，而来不及拿出赭鞭，毒发身亡。
神农三十岁即帝位，在位执政虚记三十四年，（王大有《三皇五帝时代》），卒于神农三十三年（戊辰，前4733），终年六十三岁。 神农死后，遗体葬在秦岭莲花台（今陕西宝鸡市常羊山），帝号神农，尊号炎帝。
死去的神农魂魄飘飘荡荡，回到姜水，来曹开面前，曹开言道：“你当功德圆满，不能再停留人间。” 神农大哭，对曹开言道：“小弟千辛万苦，历尽万辛，尝试百草，就要功成之日，安能就此离开！”说完悲哭不停。 曹开见他如此，也就说道：“你且写出心得体会，制成书稿，我自会教给人主，你不必担心。”
于是，神农口述，曹开执笔，行云流水般把这本药草书籍完成，最后曹开定名为《神农本草经》。
一道清风拂过，飞到陈都，落在人主临魁的桌面上。临魁为神农长子，神农逝世，氏族联盟推举其为人主，继承父亲衣钵，加持“炎帝”称号。 他正为父亲去世而悲伤啼哭，突然一阵异风刮过，桌子上出现一本书籍，乃是兽皮缝制而成，密密麻麻的字体绘就其上，封面是“神农本草经”，临魁一见，以为父皇灵魂难安，特来赐下宝书，朝宝书跪拜，发誓会将此书公诸于众，让人族共享，不让父亲留下遗憾。
就在这时，姜水流域一时之间紫气东来三万里，瑞气千条，紫气弥漫，一紫袍道人呼喊道：“人主神农氏接太上教主道德天尊诏敕。” 神农一愣，茫然的望向曹开，曹开对他点点头，说道：“还不快去接旨。” 神农连忙出屋，跪倒在地，只听天空之中传来渺渺仙音： “太上无极混元教主道德天尊敕曰：汝为先天大神，得道紫霄，曾闻至道然未证菩提，有心日修持，贪痴未脱；有身出入圣，嗔怒难除，须至往愆累积，劫运相寻。故为人所害，何其悲哉！幸得恒宇大神庇护，得保无虞。今降世为人，德行圆满。训牛以耕，积麻衣革，陶石木具，首创农耕，搭架采药，日中为市，穿井灌溉，功德无量！ 今奉太上道德天尊敕命封为人族人皇皇，秉持火德，为炎帝，往居火云洞修行，不染因果，当万劫不灭！ 尔其钦哉！”
玄都大法师宣读完太上教主道德天尊老子诏敕，就见神农三跪九叩，双手接过符诏。
顿时，天机转动，命运长河陡起波澜，一声凤鸣，一指通体火红的凤凰从万顷水波之中腾空而起，顾盼之间，舞动艳丽羽翼，修长尾羽划出道道流星般的痕迹，双翼伸展，飞落九天。 就见在一片金花之中，一火凤燃着熊熊大火，从万丈高空翩翩落下，口衔一枚火丹，其内却含一看似凝实的玄黄宝丹，分外奇异。 就在神农目瞪口呆，不知所措之际，那枚火丹吐出，化作一道霞光飞入神农微张的檀口之中。瞬息之间，一股温泉润体的感觉贯穿四肢百脉，周身四万八千毛孔舒张，无数身体污浊之气排泄一空，与其火德之体相得益彰。 一时之间，丹火引动神农血脉，周身三尺之内尽皆红光爆闪，没有燥热焦灼之感，只有如同阳春三月般的浓浓暖意。 待得那火丹外围火气被神农吸收，锻造一番神魂，重塑一具身体。骤然里 面那玄黄宝丹爆发，无数玄黄之气喷涌，在神农体内来回冲刷，最后汇聚于头部泥丸宫，冲破关锁，直入识海，亩田大小黄云铺展开来，将神农识海占得密密麻麻，破开无数空间，开拓领域，待得扩至十倍有余，才慢慢减速，云气一阵翻滚，将识海周遭屏障稳定下来。 光华闪耀，如同闪电游窜，黄云塌陷，凝结成万朵莲花，飘飘荡荡，在识海驻留，无数天地灵气从神农眉心涌入，播土扬尘，飞沙走石，山间孕育的烟霞彩岚滚滚而来，汇成彩虹般的气流打着旋往神农涌来。 当真是气象万千，不同凡响！灵气进入识海之中，化作甘霖，淅淅沥沥的洒落，汇聚成一洼水，青碧之色，不时闪烁一抹亮光。 小溪汇聚，不断壮大，半盏茶时分， 就从一洼浅水，变成一亩大小的灵水湖泊，五朵黄莲漂浮其上，绽放宝光，如同仙境，仙气盎然。 待得灵气饱满，身体毛孔封闭，眉心宛转间，毫光一闪即逝，灵气纽带被掐断，无数聚拢而来的灵气慢慢散溢。 而神农无暇顾及，只觉识海之内卷起滔天大浪，一朵朵黄莲扶摇直上，长至百丈高下，花盘大如车轮，枝叶如同芭蕉枝叶厚大，青翠欲滴，点点露珠浮动，清亮晶莹，灵动至极。 黄莲徐徐转动，不想同时朝高空喷吐无量玄黄之气，凝实纯净，透顶而出。只看见神农脑后冒出汩汩云气，还不曾看的分明，那团云气已经化作一圆轮，盘踞神农脑后，如同一轮黄色太阳从其背后升起，衬托得神农如同金阙贬谪的九天仙人，神采不凡。
功德金轮投射无量光辉，此光无形无色，横扫洪荒人族，人族不见其光芒，不见其色彩，却从心中升起一股对人皇神农氏的无限崇敬，对炎帝大德的由衷感激，一时之间，不由悲从心中来，哭哭啼啼，哀号炎帝逝世，世间又失去一位贤者圣人。
神农被这从天而降的功德一下子将道行提高到深不可测的地步，瞬息之间就明白了自己乃是先天大神，应天命转劫，顺应道家之意，显化牛首，托生人族，为人教大兴的推动者，顺应天机，得享寿福，获此无量功德，从此当不生不灭，安度无量量劫而不灭！ 九声龙吟响起，将还在沉思中的神农惊醒，就见天际有九头身姿矫健俊美的神龙拖着一车辇而来，通体异香，用珍稀木材沉香木打造，九条神龙呈现赤橙黄绿青蓝紫外加黑白二色，清气托足，瑞气相随，紫雾腾腾，彩烟迷蒙，九条俯首，静候神农。
玄都大法师催促一番，神农依依不舍，朝曹开所在的茅草屋一拜，登上车辇，九龙咆哮，放开法力，拉起宝车，直闯云涛碧海，往火云洞而去。
玄都大法师亦朝茅屋一拜，驾起紫云，慢慢悠悠的朝首山而去。 曹开叹息一声，一挥手，茅屋不见，人烟全无，不知所踪。五庄观大仙，多年忧郁一扫而光。
神农纳奔水氏之女曰听妃詙，为妃。生帝魁，魁生帝承，承生帝明，明生帝直，直生帝氂，氂生帝哀，哀生帝克，克生帝榆罔。凡八代，五百三十年。而轩辕氏兴焉。
即神农氏传承到第八代神农氏炎帝姜榆罔的时候，开始大权旁落，被兴起的公孙轩辕所取代，成为氏族联盟新的掌权者。
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