1684年，康熙皇帝刚刚收复台湾，心情无比激动，孤悬海外多年的台湾，又回到祖国的怀抱！
但是，康熙皇帝乘兴之时，又有一连串让他败兴的消息传来：“蒙古准格尔部首领葛尔丹最近祸害四邻，为害草原，反叛朝廷之意显现，望朝廷严加注意其动向。”
听到这个消息，康熙皇帝倒吸了一口气。当时，同沙俄军队的雅克萨战役正在进行，又要兴兵讨伐葛尔丹，朝廷面临两头作战，对于刚刚恢复元气的朝廷来说，是很不利的。
康熙一时陷入忧虑之中。这是，大学士明珠出班奏道：“启奏皇上，蒙古人口众多，所占地域宽广，民风凶悍，难以驯服。自太祖时期起，就对蒙古采取联姻、怀柔策略，现在雅克萨战争正酣，是否考虑暂不进行兵戎相见，稳定为宜！”
但是，户部尚书索额图看了看明珠，出班奏道：“启奏皇上，据这段时间来自草原的消息，葛尔丹在草原为非作歹，吞并各部的草场，若不及早制止，会酿出不可收拾的局面。据说，沙俄政府也在暗中笼络葛尔丹，在这个情况下，打掉葛尔丹，也是斩断沙俄窥伺我国利爪，臣认为，朝廷硬派兵打葛尔丹！”
他们总是这样针锋相对，针尖对麦芒！
康熙听了他们的所奏，心里更加烦躁。他已经有所察觉，这两位大臣已经在朝里搞宗派，搞派系争斗，弄得朝里乌烟瘴气。
康熙心里烦躁，生气地摆手大声说：“你们不用说了。”大臣们面面相觑，他们认为康熙是因为葛尔丹的事情而烦躁，殊不知康熙烦躁的缘由，在于其他。真是知其然而不其所以然。
康熙面色严峻地下了朝，回到养心殿。但是，康熙是一心扑在朝政上的一个皇帝，下了朝也在心思早朝上的事情。这个葛尔丹真让康熙心烦意乱，他强占草原各部的草场，使得北部边境动荡，沙俄有可能乘虚而入，若不及时制止，后果不堪设想。
这时，执事太监报告：“启奏皇上，理藩院尚书阿喇尼求见。”
康熙一听大喜，在清廷内，理藩院是主管民族事务的，在理论上，葛尔丹的事情属于理藩院的管辖范围。阿喇尼这么晚求见，康熙料想他可能有什么事。康熙就让阿喇尼进来。
阿拉尼跪在康熙面前：“吾皇万岁，万岁，万万岁。”
康熙看了看阿喇尼问道：“爱卿有什么事，这么晚了要求见朕？你起来说话。”
“皇上，臣以为，现在雅克萨战役在即，如若发动征讨葛尔丹之战，朝廷两头作战，过于冒然。臣主张，不如派人去调停一下草原各部落的争端为宜。”
康熙一听，眉宇展开，是啊，这是个好办法，先礼后兵嘛，再征讨葛尔丹也有理在先。
“准奏，朕认为，这是个好办法，可以兵不血刃解决问题。那么派谁去调停呢？”
“解决草原争端是理藩院的事，臣愿往。”阿喇尼作为文官却铁骨铮铮，康熙用赞赏的目光看着阿喇尼，点了点头。
康熙即命阿喇尼为钦差大臣，处理北部草原问题。康熙愁绪绵绵的葛尔丹问题，终被胆大心细的阿喇尼所破解。
阿喇尼到了草原，以朝廷钦差大臣身份着急冲突各方：即喀尔喀各部和葛尔丹举行会盟。阿喇尼很高兴，刚要给朝廷奏报这一喜事，和平局面很快又被葛尔丹的图谋打乱了！
葛尔丹已经举兵攻击喀尔喀各部。草原上一时烽烟四起，刀光剑影，血流成河，草原各部的混战全面爆发了！
钦差阿喇尼没办法了，他制止不了葛尔丹分两路进攻的三万人马，也制止不了草原上的血腥杀戮。阿喇尼望着死尸成堆的草原，给康熙写着充满了悲怆的奏折：草原上的争端非我辈所能解决了的，朝廷只有发兵，制住葛尔丹，草原也许能得到安宁。
但是，康熙认为葛尔丹正在锋芒毕露，此时朝廷派兵，只能引起更大的一场战斗，再说眼科撒战役还没有结束，还是以安抚为主要手段。他命令阿喇尼以朝廷钦差的令葛尔丹回到原来他的边界以内。
阿喇尼怀着忐忑不安的心，来到葛尔丹的军营中。傲慢的葛尔丹看了一眼阿喇尼，问道：“你来有何贵干？”傲慢至极的葛尔丹连坐都没让坐。
阿喇尼虽说是个文人，但是胆子很大，他大胆地向葛尔丹宣布：“皇上下了谕令，命你
部西归原草场，退还所占喀尔喀各部草原。”
听了阿喇尼宣布的皇帝谕令，葛尔丹一撇嘴，竟然笑了：“一个孩子的话怎么能当谕令呢？回去告诉康熙，他的谕令我知道了。”往下他也没有什么动作。看来他是一心想与朝廷做对了。
阿喇尼想得很对，葛尔丹学成吉思汗，妄想同意草原，统一整个蒙古。
后来阿喇尼了解到，葛尔丹多次与沙俄协商，妄图借沙俄的力量南攻大清！葛尔丹的军队已经深入漠南蒙古的中部掠夺财物，霸占土地。这一情况非同小可。阿喇尼感到事态严重，赶紧回到京城，面陈康熙皇帝。
康熙皇帝认为，必须稳住沙俄，不能让葛尔丹与沙俄联手。如果沙俄也参与草原的争端，那么草原之争就升级，变成国际争端，那么事情就变得更加复杂，更加难办。
这时候雅克萨战役已经结束，朝廷与沙俄政府正在签订《中俄尼布楚条约》，康熙决定继续与沙俄谈判，割让大片土地给沙俄，以换取沙俄的中立。沙俄也表示不愿参与葛尔丹的军事行动。
康熙认为征讨葛尔丹的时机已到，于是决定起兵征讨葛尔丹，扼住他的势头，以根绝后患。
理藩院尚书阿喇尼出班奏道：“皇上，上次臣没能完成使命，致使朝廷威名扫地，臣愿带兵前往，攻打葛尔丹！”
康熙一看，阿喇尼是个文官，从未上过战场，但一见他的决心很大，就说：“好，朕给你六千骑兵，赶到乌珠穆沁部，去抵挡葛尔丹的南侵！”
“是！”
康熙不放心阿喇尼，告诫说：“记住，跟葛尔丹打仗要小心，葛尔丹诡计多端，不要上当！”
“是！”
清康熙二十九年（1689年），阿喇尼率领六千骑兵日夜兼程，到了乌珠穆沁，漠南蒙古各部派兵相助，阿喇尼军将士一时达到两万人，与葛尔丹军差不多。
阿喇尼带领朝廷将士与葛尔丹军在乌珠穆沁的乌拉盖河大战，双方人数相当，都是骑兵，战斗打响，只见刀光闪闪，马嘶阵阵，尘土飞扬，杀声震天，别有一番景象。起初，阿喇尼的军队获胜。但是，喀尔喀部军急于夺还其被俘的人和牲畜，因互相争夺而阵脚大乱，阿喇尼的军队反被葛尔丹军所击败，五百辆战车和全部武器都被抢走，葛尔丹取得全面胜利。
望着溃败的朝廷军队，望着众多的战利品，葛尔丹哈哈大笑，“康熙的军队也不过如此，看来，谁也挡不住我的铁骑。”他认为，大清的势力很弱，很容易打败。于是葛尔丹下令继续往南进军。
葛尔丹军半道上没有遇到有效的抵抗，他带领所部渡过辽河，长驱直入接近北京，进至北京以北350公里的乌兰布通。北京震动，为之戒严。
康熙得到这个消息，吃了一惊，这个葛尔丹是要威胁我大清啊。康熙是有魄力的，葛尔丹非要消灭不可，他决定御驾亲征。
他看出葛尔丹的战斗力很强，非要集结很大的兵力，把他消灭在草原旷野上。他决定集结10万军队集结在长城一线驻守，防止葛尔丹军攻击北京。
康熙皇帝决定集聚清军主力，动用英勇善战的皇亲国戚等国之栋梁。康熙要动用全国的力量来对付葛尔丹。
1690年9月2日，康熙皇帝命令皇兄裕亲王福全为“抚远大将军”，皇长子胤惿为副将军，率领集结在长城古北口内外的清军为左翼军，并由古北口往北进击。命皇弟恭亲王常宁为“安北大将军”，简亲王雅布、信郡王鄂札为副将军，率领集结在长城喜峰口内外的军队为右翼军，由喜峰口北上进击。
内大臣佟国刚、佟国维、索额图、明珠、阿密达等均总从征参赞军务。康熙皇帝为了整个战役的万无一失，又命盛京将军和吉林将军各率所部和科尔沁等蒙古八旗军，进入西辽河、桃儿河流域，从侧翼协助主力军作战。
康熙皇帝随后随主力跟进。整个军队行列的布置，可说是万无一失，葛尔丹必败无疑。
可惜，康熙皇帝突然身体不适，无法再指挥作战，整个作战计划就搁浅了。
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