由于康熙皇帝又投入一支反藩的有生力量，南方反藩的战争急转直下，吴三桂的藩兵节节后退，形势一片大好。
眼看自己的力量渐渐削弱，处境变得越来越孤立，74岁的吴三桂似乎看到了自己暗淡的前景。这时候的吴三桂身体更弱，牙齿掉了一多半，每天使人沮丧的战报，是他的心情很坏，连走路也摇摇晃晃要人搀扶了。
这时候，他起事已经五年了，然而他的野心还在恶性膨胀，他甚至在想：我的势力一天不如一天，身体也很差，看样子就是打到京城，也做不成皇帝。正好明朝皇族也已灭绝，我何不做一回皇帝过过瘾呢？
于是，在1678年，也就是康熙十七年，吴三桂终于扯下“反清复明”的遮羞布，公然在衡州筑坛，祭告天地，穿上了黄袍，做起了皇帝。吴三桂下令改元昭武，并大封大臣将军，一时，文武将官满天飞。
吴三桂是临时策划当皇帝的，时间很仓促，弄得一切都很匆匆了事，连殿瓦都来不及换一换，就简单地刷了黄漆，搭了几百间庐舍算是朝房。
吴三桂就这样就要登上皇位了。三月十五日那天，是吴三桂“登基”的日子。一时，朝乐四起，香烟缭绕，大有开国之风。
可是，怪事连连。仪式开始时，还万里无云的晴朗好天气。吴三桂刚坐上“龙位”，一切静谧的境况都变了：一阵狂风吹来，黑压压的云彩挤满了刚才还是晴空万里的天空，一场票盆大雨突然而至。
立时，仪式上的一切都被淋在雨中了，变得狼藉一片：朝房被雨水冲倒了，瓦上的黄漆也被雨冲刷掉了。吴三桂看着这不祥的一切，神情很是沮丧。也许天不容我如此做作，难道老天是在有意亡我？
也是凑巧，凑巧这时候他刚任命的执事官向他禀报：军队在战场上被康熙的军队打得大败。这个坏消息在吴三桂听起来，是那么不吉利，像是在给他敲响了丧钟！
吴三桂听罢又气又惊，一口上不来，往后便倒。从此他再也没起来，他中风了！
本来，登基是他的好时候，可也是他的坏时候，在登基的时候中风，也许就是吴三桂的天数！
从此吴三桂就病倒了。他时而发冷，时而发热，吃不下也喝不下，还发烧说胡话：一会儿喊“皇上饶命！”一会儿喊“永历皇帝饶命！”，一会儿喊“崇祯皇帝饶命！”弄得“太医”都素手无策。
8月17日，吴三桂终于结束了他丑恶的一生。按照吴三桂的生前安排，他的孙子吴世璠继承他的“皇位”。吴世璠继承吴三桂的衣钵，继续与大清朝对抗，拒不投降。
战争还在继续。但是，参战清军的精神面貌明显不一样了。清军将士们一听说吴三桂死了，感到胜利在望，就人人争先，个个奋力，而叛军的情况就不同了，吴世璠还是个孩子，根本没有统御下属的能力。而下属们也一看吴三桂已死，知道大势已去，就纷纷投降大清。
这样，叛军的势力越来越弱，地盘也越来越小。最后就剩下云南一省了。
康熙连连接到战报后，心里很高兴。虽然国家的财物消耗很多，人员伤亡很多，但是，平叛战争就要胜利了，三藩这个大清国的毒瘤终于要铲除了。朝廷从此要走向健康辉煌了，祖辈没有做到的事情，他康熙就要做到了。
平叛战争就要得到最后胜利了。需要再接再厉，一鼓作气，继续努力。但是，康熙又想到，平叛战争已经历时快七年，将士们也许已经厌战。这个时候要不是赏罚分明，必定涣散军心。康熙联想到过去战争中有些人的一贯表现，心里有了主意。
于是，康熙皇帝下令让在平叛前线作战的顺城君王勒尔锦、简亲王剌布，贝子洞鄂、贝勒尚善等回京，说他们作战不力，劳师误国，一律治罪。其实康熙心里隐隐在作痛，为了取得战争的最后胜利，他们就做一点牺牲吧。
康熙又下旨，因康亲王杰书和安亲王岳乐在外久劳，作战有功，遂召还京师加以重用。这样，康熙皇帝就有了赏罚分明的美誉。
康熙皇帝又发一道谕旨，目的是借以安抚军民。大意是战时军队的所有借贷，战后一定返还，还有战时的功臣，战后一定论功行赏。
康熙皇帝的这一招很见功效，君命一下达，将士们都格外效命。但是，昆明城吴三桂经营多年，城墙很坚固，不易攻破。康熙皇帝发了狠招，命人借助洋人的力量造了许多火炮，悉数运到昆明城下，填下炮弹，齐射出去。然后，清军有加紧了攻城的力度。
这是古代战争最厉害的攻城手段。至康熙二十年十月，清兵一举攻下了叛军占领的昆明城，大势已去的严世璠只得选择自杀。至此，历时八年之久的三藩之战终于一朝廷的胜利而结束。
紧接着，康熙下手治理其他两藩，这就容易得多了。康熙命人把尚之信和耿精忠押解到京城，一律处死。
平定三藩的战争是康熙皇帝在清初发起的一场历时八年之久的战争。在这次战争中，表现了康熙皇帝卓越的军事才能，良好的精神素质，远大的战略眼光。
这次战争其实康熙是很难的，客观上来说，三藩有强大的军事势力，他们占据南方最富裕的区域。而且其时正逢察哈尔王也叛变朝廷。康熙处于两面作战的危险境地。但是，康熙皇帝有很强的调配和指挥能力，灵活的驾驭人的特别艺术。最后取得了战胜三藩的伟大胜利。
三藩之乱最终得以平定，从而巩固了清朝在全国范围内的统治，维护了国家的进一步统一。
大臣们都向康熙皇帝表示祝贺。在群臣中间，他看到了周培公。康熙皇帝心里一亮：周培公是个大功臣，他应该受奖职位应该上升啊。
现在朝中有功大臣论功行赏都接近尾声了，可是周培公呢？这位中流砥柱呢？该怎么对他呢？
他给康熙皇帝出了很多有用的注意，招募到反击察哈尔王叛乱的生力军。他训练这支生力军，平定察哈尔王叛乱，又去平定吴三桂叛乱。可以说，在整个平叛中，周培公起了中流砥柱的作用。
康熙不说话，说实在话，他真想给周培公以适当的职位，给予适当的奖励。
可是，康熙皇帝感到困难重重，因为他是汉臣啊。在满族当政的大清王朝中，汉臣是不该受重用，不该受奖励的。吴三桂就是一个铁的例子啊。
康熙皇帝心情沉重地回到养心殿。那么对于功劳很大的周培公就这样不论功行赏吗？这对他这位有功之臣是多么的不公啊！
他实在想不出办法，祖上的规矩太严了，不容他有所超越。如果超越这条线，他康熙不就成逆子了吗？但是，周培公不奖励也不行啊，不就显得我康熙说话不算话了吗？
他让执事太监通知一些重要大臣，包括明珠、索额图、康亲王杰书、还有图海等。
不一会儿，大臣们奉康熙之命来到养心殿。
康熙坐在高高的御座上，看了看底下跪着的大臣们问道：“吴三桂叛乱平定了，朕问问你们，有功人员是不是得到奖赏？”
几乎所有的大臣都面面相觑，然后齐声禀告皇上：“这是皇上您定的规定，有功人员当然要受奖赏了。”
康熙又问道：“这个规定对所有的人都实行吗？”
大家又面面相觑，都在心里打鼓：皇上这是怎么了？净问这么奇怪的问题。然后又都齐声奏道：“对所有的人都适用。”
“朕再问你们，对于周培公也适用吗？”康熙说话很严肃。
大臣们不说话了，他们一起沉默了。有些人偷偷地看着别人，但是谁也不说话。康熙明白他们的心理，这是个敏感的问题，说错了会引来杀身之祸的。
康熙一看大臣都不说话，心里有点不高兴了，提高声音问道：“怎么不说话啦？请你们来算白请了？”
明珠看了看威严的康熙皇帝，又看了看众大臣：“臣以为，周培公是汉臣，不在论功行赏之列。”众大臣都点头，表示同意明珠的观点。
康熙又反问大家：“朕问你们，你们谁的功绩超过周培公？”
“臣等自叹不如。”众大臣几乎是异口同声说道，看来他们的观点都相同。
“那么，周培公在论功行赏之列了？他该不该立功受奖？”康熙说话句句在理。
“周培公在论功行赏之列，可是按照咱们清朝祖制，汉人不能立功受奖啊。”众大臣几乎异口同声地说。康熙暗暗生气，这些大臣遇到原则问题，就寸步不让。
康熙呆呆地看着这些固执的大臣，他实在没办法，他也不能破坏祖制啊。
他暗暗地叹了一声，“众卿都回去吧。”
第二天，康熙下了一道谕旨：鉴于周培公的功劳很大，鉴于他是汉人，准予他破例守祖先的皇陵。
康熙看见周培公不理解地看了一下康熙皇帝，接受了谕旨。
